Журнал «Экосистемы» основан в 1979 году и издавался под разными названиями как Тематический сборник научных трудов Симферопольского государственного, Таврического национального, а ныне – Крымского федерального университета имени В. И. Вернадского. С 2002 по 2014 год издавался под названием «Экосистемы, их оптимизация и охрана», с 2015 года выходит под новым названием – «Экосистемы».

Научный журнал «Экосистемы» – это рецензируемое научное издание, в котором публикуются результаты зоологических и ботанических исследований, материалы комплексного изучения флоры, фауны, фито- и зооценозов, экологии и биологии видов, по охране растительного и животного мира и сохранению биоразнообразия. Адресуется преподавателям, научным сотрудникам, аспирантам, магистрантам и студентам университетов и научных организаций. Языки публикаций – русский, английский. Журнал издаётся 4 раза в год.

Учредитель и издатель научного журнала – Федеральное государственное автономное образовательное учреждение высшего образования «Крымский федеральный университет имени В.И. Вернадского»

Сведения о регистрации: ПИ № ФС 77-61820 от 18.05.2015

Сведения о наличии международного стандартного номера серийного издания: ISSN 2414-4738

DOI 10.37279/2414-4738

С 5 декабря 2017 года журнал включен в «Перечень рецензируемых научных изданий, в которых должны быть опубликованы основные научные результаты диссертаций на соискание ученой степени кандидата наук, на соискание ученой степени доктора наук».

В соответствии с распоряжением Минобрнауки России от 28 декабря 2018 года № 90-р, журнал считается включенным в Перечень ВАК по следующим научным специальностям и соответствующим им отраслям наук:

03.02.01 – Ботаника (биологические науки),
03.02.08 – Экология (по отраслям) (биологические науки).